Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-HP01893 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-HP01893 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-HP01893 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-HP01893 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-HP01893 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-HP01893 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-HP01893 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-HP01893 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-HP01893 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-HP01893 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-HP01893 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms