Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTAP01040 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTAP01040 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTAP01040 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTAP01040 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTAP01040 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTAP01040 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTAP01040 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTAP01040 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTAP01040 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTAP01040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTAP01040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTAP01040 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTAP01040 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTAP01040 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTAP01040 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTAP01040 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTAP01040 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTAP01040 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTAP01040 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTAP01040 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTAP01040 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTAP01040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTAP01040 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTAP01040 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTAP01040 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTAP01040 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTAP01040 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTAP01040 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTAP01040 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTAP01040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTAP01040 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTAP01040 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTAP01040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTAP01040 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSTAP01040 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTAP01040 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTAP01040 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTAP01040 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTAP01040 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTAP01040 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTAP01040 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTAP01040 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTAP01040 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTAP01040 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTAP01040 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTAP01040 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTAP01040 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTAP01040 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTAP01040 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTAP01040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTAP01040 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTAP01040 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTAP01040 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTAP01040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTAP01040 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTAP01040 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTAP01040 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTAP01040 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTAP01040 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTAP01040 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTAP01040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTAP01040 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms