Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN4O95460 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN4O95460 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN4O95460 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN4O95460 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN4O95460 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN4O95460 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN4O95460 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MATN4O95460 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN4O95460 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN4O95460 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN4O95460 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN4O95460 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN4O95460 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN4O95460 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN4O95460 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN4O95460 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN4O95460 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN4O95460 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN4O95460 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN4O95460 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN4O95460 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN4O95460 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN4O95460 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN4O95460 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN4O95460 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN4O95460 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN4O95460 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN4O95460 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN4O95460 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN4O95460 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN4O95460 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN4O95460 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN4O95460 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN4O95460 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN4O95460 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN4O95460 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN4O95460 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN4O95460 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MATN4O95460 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MATN4O95460 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MATN4O95460 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MATN4O95460 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MATN4O95460 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MATN4O95460 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MATN4O95460 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN4O95460 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN4O95460 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MATN4O95460 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MATN4O95460 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms