Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATE1O95260 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATE1O95260 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATE1O95260 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATE1O95260 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATE1O95260 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATE1O95260 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATE1O95260 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATE1O95260 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATE1O95260 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATE1O95260 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATE1O95260 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATE1O95260 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATE1O95260 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATE1O95260 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATE1O95260 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATE1O95260 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATE1O95260 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATE1O95260 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATE1O95260 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATE1O95260 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATE1O95260 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATE1O95260 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATE1O95260 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATE1O95260 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATE1O95260 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATE1O95260 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATE1O95260 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATE1O95260 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATE1O95260 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATE1O95260 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATE1O95260 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATE1O95260 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATE1O95260 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATE1O95260 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATE1O95260 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATE1O95260 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATE1O95260 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATE1O95260 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATE1O95260 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATE1O95260 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATE1O95260 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATE1O95260 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATE1O95260 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATE1O95260 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATE1O95260 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATE1O95260 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATE1O95260 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATE1O95260 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATE1O95260 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATE1O95260 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATE1O95260 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATE1O95260 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATE1O95260 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATE1O95260 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATE1O95260 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATE1O95260 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATE1O95260 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATE1O95260 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATE1O95260 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATE1O95260 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATE1O95260 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATE1O95260 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATE1O95260 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATE1O95260 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATE1O95260 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATE1O95260 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATE1O95260 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATE1O95260 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATE1O95260 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms