Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM1O95202 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM1O95202 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM1O95202 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LETM1O95202 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LETM1O95202 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LETM1O95202 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LETM1O95202 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LETM1O95202 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LETM1O95202 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LETM1O95202 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LETM1O95202 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LETM1O95202 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LETM1O95202 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LETM1O95202 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM1O95202 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM1O95202 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM1O95202 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM1O95202 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LETM1O95202 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM1O95202 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LETM1O95202 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM1O95202 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LETM1O95202 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM1O95202 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM1O95202 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LETM1O95202 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LETM1O95202 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LETM1O95202 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LETM1O95202 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM1O95202 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM1O95202 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LETM1O95202 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM1O95202 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM1O95202 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM1O95202 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM1O95202 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LETM1O95202 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LETM1O95202 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LETM1O95202 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LETM1O95202 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LETM1O95202 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LETM1O95202 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM1O95202 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM1O95202 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM1O95202 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LETM1O95202 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM1O95202 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM1O95202 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LETM1O95202 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM1O95202 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LETM1O95202 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LETM1O95202 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LETM1O95202 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LETM1O95202 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LETM1O95202 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM1O95202 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM1O95202 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LETM1O95202 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LETM1O95202 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LETM1O95202 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM1O95202 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM1O95202 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM1O95202 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LETM1O95202 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM1O95202 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM1O95202 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LETM1O95202 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LETM1O95202 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LETM1O95202 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LETM1O95202 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LETM1O95202 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LETM1O95202 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM1O95202 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LETM1O95202 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM1O95202 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM1O95202 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM1O95202 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM1O95202 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LETM1O95202 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LETM1O95202 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM1O95202 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LETM1O95202 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM1O95202 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM1O95202 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LETM1O95202 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LETM1O95202 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LETM1O95202 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM1O95202 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM1O95202 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM1O95202 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LETM1O95202 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LETM1O95202 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LETM1O95202 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LETM1O95202 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms