Protein–RNA interactions for Protein: O94989

ARHGEF15, Rho guanine nucleotide exchange factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF15O94989 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF15O94989 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF15O94989 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF15O94989 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF15O94989 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF15O94989 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF15O94989 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF15O94989 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF15O94989 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms