Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK1O94907 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK1O94907 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DKK1O94907 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK1O94907 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK1O94907 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK1O94907 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DKK1O94907 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DKK1O94907 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DKK1O94907 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DKK1O94907 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DKK1O94907 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK1O94907 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK1O94907 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK1O94907 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DKK1O94907 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK1O94907 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DKK1O94907 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK1O94907 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK1O94907 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK1O94907 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK1O94907 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DKK1O94907 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK1O94907 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK1O94907 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DKK1O94907 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DKK1O94907 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DKK1O94907 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DKK1O94907 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DKK1O94907 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DKK1O94907 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DKK1O94907 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DKK1O94907 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DKK1O94907 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DKK1O94907 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DKK1O94907 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK1O94907 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK1O94907 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK1O94907 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK1O94907 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK1O94907 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK1O94907 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK1O94907 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DKK1O94907 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DKK1O94907 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DKK1O94907 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DKK1O94907 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DKK1O94907 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DKK1O94907 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DKK1O94907 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK1O94907 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
DKK1O94907 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DKK1O94907 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DKK1O94907 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK1O94907 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK1O94907 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK1O94907 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK1O94907 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK1O94907 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK1O94907 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK1O94907 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK1O94907 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK1O94907 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK1O94907 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK1O94907 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK1O94907 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK1O94907 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK1O94907 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK1O94907 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK1O94907 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK1O94907 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK1O94907 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK1O94907 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK1O94907 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK1O94907 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK1O94907 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK1O94907 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DKK1O94907 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms