Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKRAO75569 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKRAO75569 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKRAO75569 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms