Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPSNAP2O75323 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPSNAP2O75323 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPSNAP2O75323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPSNAP2O75323 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms