Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP12O75317 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP12O75317 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP12O75317 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP12O75317 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP12O75317 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP12O75317 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP12O75317 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP12O75317 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP12O75317 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP12O75317 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP12O75317 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP12O75317 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP12O75317 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP12O75317 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP12O75317 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP12O75317 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP12O75317 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP12O75317 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP12O75317 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP12O75317 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP12O75317 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP12O75317 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP12O75317 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP12O75317 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP12O75317 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP12O75317 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP12O75317 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP12O75317 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP12O75317 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP12O75317 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP12O75317 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP12O75317 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP12O75317 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP12O75317 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP12O75317 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP12O75317 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP12O75317 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP12O75317 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP12O75317 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP12O75317 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP12O75317 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP12O75317 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP12O75317 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP12O75317 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP12O75317 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP12O75317 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP12O75317 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP12O75317 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP12O75317 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP12O75317 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP12O75317 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP12O75317 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP12O75317 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP12O75317 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP12O75317 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP12O75317 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP12O75317 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP12O75317 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP12O75317 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP12O75317 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP12O75317 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP12O75317 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP12O75317 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP12O75317 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP12O75317 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP12O75317 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP12O75317 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP12O75317 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP12O75317 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP12O75317 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms