Protein–RNA interactions for Protein: O60942

RNGTT, mRNA-capping enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNGTTO60942 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNGTTO60942 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNGTTO60942 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNGTTO60942 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNGTTO60942 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms