Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRD4O60885 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRD4O60885 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRD4O60885 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRD4O60885 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BRD4O60885 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BRD4O60885 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
BRD4O60885 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRD4O60885 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRD4O60885 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRD4O60885 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRD4O60885 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRD4O60885 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRD4O60885 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRD4O60885 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRD4O60885 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
BRD4O60885 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
BRD4O60885 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BRD4O60885 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRD4O60885 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRD4O60885 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRD4O60885 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRD4O60885 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRD4O60885 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRD4O60885 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
BRD4O60885 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRD4O60885 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRD4O60885 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRD4O60885 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRD4O60885 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRD4O60885 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRD4O60885 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRD4O60885 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRD4O60885 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRD4O60885 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRD4O60885 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRD4O60885 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRD4O60885 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BRD4O60885 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRD4O60885 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRD4O60885 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRD4O60885 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRD4O60885 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRD4O60885 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRD4O60885 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
BRD4O60885 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRD4O60885 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRD4O60885 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRD4O60885 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRD4O60885 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BRD4O60885 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BRD4O60885 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRD4O60885 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRD4O60885 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
BRD4O60885 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BRD4O60885 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BRD4O60885 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BRD4O60885 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BRD4O60885 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BRD4O60885 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
BRD4O60885 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRD4O60885 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRD4O60885 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRD4O60885 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
BRD4O60885 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
BRD4O60885 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRD4O60885 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
BRD4O60885 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BRD4O60885 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
BRD4O60885 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BRD4O60885 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BRD4O60885 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BRD4O60885 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
BRD4O60885 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
BRD4O60885 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
BRD4O60885 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
BRD4O60885 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BRD4O60885 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BRD4O60885 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BRD4O60885 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
BRD4O60885 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms