Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF10O60809 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF10O60809 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF10O60809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF10O60809 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms