Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDSO60760 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDSO60760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDSO60760 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms