Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC52.94■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.93■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC52.93■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC52.93■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC52.92■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC52.92■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.9■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC52.89■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC52.88■■■■■ 6.06
ABCC9O60706 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC52.87■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC52.86■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC52.85■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
ABCC9O60706 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.8■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.79■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC52.79■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC52.78■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.78■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC9O60706 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC52.74■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC52.73■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC52.71■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.7■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.7■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC52.7■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.03
ABCC9O60706 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC52.65■■■■■ 6.02
ABCC9O60706 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC52.62■■■■■ 6.01
ABCC9O60706 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC52.61■■■■■ 6.01
ABCC9O60706 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
ABCC9O60706 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC52.57■■■■■ 6.01
ABCC9O60706 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
ABCC9O60706 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
ABCC9O60706 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.54■■■■■ 6
ABCC9O60706 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC52.54■■■■■ 6
ABCC9O60706 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC52.53■■■■■ 6
ABCC9O60706 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
ABCC9O60706 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
ABCC9O60706 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC52.52■■■■■ 6
ABCC9O60706 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.47■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC52.46■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC52.45■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC52.45■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC52.44■■■■■ 5.99
ABCC9O60706 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC52.43■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC52.43■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC52.43■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.42■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC52.39■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.38■■■■■ 5.98
ABCC9O60706 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC52.36■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC52.36■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC52.35■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC52.35■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
ABCC9O60706 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC52.31■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
ABCC9O60706 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms