Protein–RNA interactions for Protein: O60304

ZNF500, Zinc finger protein 500, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF500O60304 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF500O60304 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF500O60304 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF500O60304 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF500O60304 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF500O60304 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF500O60304 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms