Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA3O43365 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA3O43365 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXA3O43365 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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