Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP290O15078 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP290O15078 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP290O15078 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP290O15078 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP290O15078 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP290O15078 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP290O15078 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP290O15078 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP290O15078 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP290O15078 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP290O15078 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP290O15078 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP290O15078 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP290O15078 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP290O15078 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP290O15078 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP290O15078 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP290O15078 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP290O15078 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP290O15078 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP290O15078 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP290O15078 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP290O15078 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP290O15078 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP290O15078 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP290O15078 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP290O15078 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP290O15078 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP290O15078 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP290O15078 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CEP290O15078 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CEP290O15078 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP290O15078 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP290O15078 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP290O15078 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP290O15078 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP290O15078 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP290O15078 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP290O15078 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP290O15078 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP290O15078 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP290O15078 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP290O15078 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP290O15078 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP290O15078 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CEP290O15078 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP290O15078 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP290O15078 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP290O15078 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP290O15078 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP290O15078 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP290O15078 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CEP290O15078 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP290O15078 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP290O15078 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP290O15078 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP290O15078 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP290O15078 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP290O15078 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP290O15078 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP290O15078 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP290O15078 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP290O15078 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP290O15078 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP290O15078 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP290O15078 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP290O15078 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP290O15078 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CEP290O15078 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP290O15078 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP290O15078 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CEP290O15078 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CEP290O15078 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP290O15078 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP290O15078 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP290O15078 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP290O15078 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP290O15078 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP290O15078 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP290O15078 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP290O15078 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP290O15078 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP290O15078 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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