Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PHOX2AO14813 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHOX2AO14813 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHOX2AO14813 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms