Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSO14618 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSO14618 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSO14618 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSO14618 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSO14618 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCSO14618 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSO14618 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCSO14618 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCSO14618 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCSO14618 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCSO14618 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSO14618 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSO14618 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCSO14618 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSO14618 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSO14618 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCSO14618 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSO14618 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSO14618 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSO14618 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCSO14618 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSO14618 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSO14618 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSO14618 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSO14618 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSO14618 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSO14618 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSO14618 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCSO14618 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSO14618 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSO14618 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSO14618 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSO14618 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSO14618 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSO14618 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSO14618 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSO14618 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCSO14618 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSO14618 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSO14618 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSO14618 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSO14618 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCSO14618 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCSO14618 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSO14618 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSO14618 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSO14618 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSO14618 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCSO14618 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSO14618 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSO14618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSO14618 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSO14618 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSO14618 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms