Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ASTN1O14525 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ASTN1O14525 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ASTN1O14525 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ASTN1O14525 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ASTN1O14525 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ASTN1O14525 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms