Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PES1O00541 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PES1O00541 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PES1O00541 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PES1O00541 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PES1O00541 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PES1O00541 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PES1O00541 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PES1O00541 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PES1O00541 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PES1O00541 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PES1O00541 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PES1O00541 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PES1O00541 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PES1O00541 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PES1O00541 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PES1O00541 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PES1O00541 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PES1O00541 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PES1O00541 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PES1O00541 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PES1O00541 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PES1O00541 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PES1O00541 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PES1O00541 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PES1O00541 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PES1O00541 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PES1O00541 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PES1O00541 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PES1O00541 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PES1O00541 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PES1O00541 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PES1O00541 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PES1O00541 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PES1O00541 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PES1O00541 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PES1O00541 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PES1O00541 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PES1O00541 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PES1O00541 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PES1O00541 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PES1O00541 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PES1O00541 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PES1O00541 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PES1O00541 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PES1O00541 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PES1O00541 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PES1O00541 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PES1O00541 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PES1O00541 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PES1O00541 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PES1O00541 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PES1O00541 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PES1O00541 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PES1O00541 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PES1O00541 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PES1O00541 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PES1O00541 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PES1O00541 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms