Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT5O00445 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT5O00445 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT5O00445 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT5O00445 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT5O00445 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT5O00445 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT5O00445 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT5O00445 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT5O00445 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT5O00445 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT5O00445 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT5O00445 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT5O00445 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT5O00445 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT5O00445 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT5O00445 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT5O00445 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT5O00445 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT5O00445 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT5O00445 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT5O00445 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT5O00445 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT5O00445 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT5O00445 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT5O00445 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT5O00445 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT5O00445 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT5O00445 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT5O00445 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT5O00445 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT5O00445 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT5O00445 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT5O00445 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT5O00445 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT5O00445 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT5O00445 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT5O00445 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT5O00445 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT5O00445 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT5O00445 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT5O00445 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT5O00445 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT5O00445 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT5O00445 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT5O00445 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT5O00445 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT5O00445 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT5O00445 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT5O00445 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT5O00445 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT5O00445 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT5O00445 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT5O00445 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT5O00445 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT5O00445 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYT5O00445 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT5O00445 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT5O00445 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT5O00445 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT5O00445 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT5O00445 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT5O00445 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT5O00445 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT5O00445 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT5O00445 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT5O00445 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT5O00445 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT5O00445 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT5O00445 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT5O00445 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms