Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DFFAO00273 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DFFAO00273 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DFFAO00273 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DFFAO00273 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DFFAO00273 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DFFAO00273 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DFFAO00273 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DFFAO00273 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DFFAO00273 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DFFAO00273 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DFFAO00273 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DFFAO00273 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DFFAO00273 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DFFAO00273 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DFFAO00273 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFFAO00273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFFAO00273 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFFAO00273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DFFAO00273 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DFFAO00273 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DFFAO00273 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFFAO00273 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFFAO00273 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DFFAO00273 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DFFAO00273 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DFFAO00273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DFFAO00273 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DFFAO00273 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DFFAO00273 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFFAO00273 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFFAO00273 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFFAO00273 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFFAO00273 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DFFAO00273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DFFAO00273 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DFFAO00273 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DFFAO00273 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DFFAO00273 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFFAO00273 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFFAO00273 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFFAO00273 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DFFAO00273 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFFAO00273 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFFAO00273 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DFFAO00273 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DFFAO00273 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DFFAO00273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DFFAO00273 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DFFAO00273 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DFFAO00273 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFFAO00273 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DFFAO00273 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DFFAO00273 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DFFAO00273 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DFFAO00273 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DFFAO00273 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DFFAO00273 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DFFAO00273 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DFFAO00273 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DFFAO00273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DFFAO00273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DFFAO00273 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFFAO00273 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFFAO00273 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DFFAO00273 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFFAO00273 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFFAO00273 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFFAO00273 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DFFAO00273 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFFAO00273 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFFAO00273 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DFFAO00273 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms