Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN8O00124 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN8O00124 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN8O00124 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN8O00124 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms