Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3QKU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
J3QKU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
J3QKU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
J3QKU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
J3QKU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QKU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
J3QKU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
J3QKU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
J3QKU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
J3QKU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
J3QKU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
J3QKU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QKU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
J3QKU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
J3QKU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
J3QKU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QKU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QKU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
J3QKU1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3QKU1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QKU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QKU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QKU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QKU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QKU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QKU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3QKU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3QKU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QKU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QKU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QKU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QKU1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3QKU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
J3QKU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms