Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms