Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms