Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF839A8K0R7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF839A8K0R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF839A8K0R7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF839A8K0R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms