Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLCD2A6NGC4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLCD2A6NGC4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLCD2A6NGC4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms