Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM247A6NEH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM247A6NEH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM247A6NEH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms