Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf51A6NDU8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C5orf51A6NDU8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C5orf51A6NDU8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C5orf51A6NDU8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms