Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAP1LC3B2A6NCE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms