Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf49A4QMS7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf49A4QMS7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C5orf49A4QMS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf49A4QMS7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf49A4QMS7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf49A4QMS7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf49A4QMS7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf49A4QMS7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf49A4QMS7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms