Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3PXD2BA1X283 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3PXD2BA1X283 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3PXD2BA1X283 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms