Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM72A0PK05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM72A0PK05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms