Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA6A0AVT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA6A0AVT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms