Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC26A0AVF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTC26A0AVF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC26A0AVF1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC26A0AVF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC26A0AVF1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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