Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE1-204ENST00000367248 7165 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024610.2-204ENST00000637478 2867 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB1-206ENST00000396332 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CTTNBP2-201ENST00000160373 5970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RACGAP1-209ENST00000547905 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf147-201ENST00000367119 2096 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN2A1-207ENST00000541522 2845 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TEC-201ENST00000381501 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1755-201ENST00000279024 6429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA6-206ENST00000442250 3393 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP324-201ENST00000365177 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM83C-AS1-201ENST00000429167 352 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000346.2-201ENST00000430707 906 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589674.1-201ENST00000454401 222 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms