Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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