Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1RE1Q9UN81 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms