Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DKK2Q9UBU2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms