Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KB2Q9UBS0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KB2Q9UBS0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KB2Q9UBS0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB2Q9UBS0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KB2Q9UBS0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms