Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ABRACLQ9P1F3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ABRACLQ9P1F3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms