Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP5Q9NZZ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP5Q9NZZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms