Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms