Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CHCHD7Q9BUK0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CHCHD7Q9BUK0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CHCHD7Q9BUK0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHCHD7Q9BUK0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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