Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms