Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
JSRP1Q96MG2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms