Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms